Fernando Hierro pertama kali bermain untuk Real Valladolid sejak 1987 dan 1989. Ia tampil 58 kali dan mencetak 3 gol. Kemudian ia pindah ke Real Madrid hingga tahun 2003. Ia tampil 439 kali dan mencetak 102 gol. Ia kemudian bermain untuk tim Qatar, Al Rayyan pada musim 2003–04, dan tampil 19 kali serta mencetak 3 gol. Terakhir, ia bermain untuk Bolton Wanderers F.C., dan tampil 29 kali serta mencetak hanya 1 gol.
Internasional
Fernando Hierro telah bermain 89 kali dan mencetak 29 gol untuk tim nasional Spanyol sepanjang kariernya bersama tim nasional sejak 1989 hingga pensiun pada tahun 2002. Ia juga pernah bermain 5 kali dan mencetak 2 gol untuk tim nasional U-21. Ia telah bermain untuk Spanyol dalam 4 edisi Piala Dunia FIFA, yakni: 1990, 1994, 1998, dan 2002, serta 2 edisi Piala Eropa, yakni: 1996 dan 2000.