MSDOS.SYS adalah inti dari sistem operasi MS-DOS yang berfungsi untuk melakukan manajemen sistem operasi MS-DOS secara keseluruhan, mulai dari manajemen proses, manajemen memori, hingga manajemen interupsi perangkat keras. Berkas ini adalah berkas yang kedua dimuat oleh DOS saat proses booting dimulai, setelah berkas IO.SYS yang merupakan antarmuka antara MS-DOS dengan BIOS.
