معايير الإبلاغ عن البيانات الإنزيمية (بالإنجليزية: Standards for Reporting Enzymology Data) هي مبادرة للمعايير الدنيا للمعلومات تركز بشكل خاص على وضع مبادئ توجيهية للإبلاغ (وصف البيانات الوصفية) للتجارب الإنزيمية. ويدعم هذه المبادرة معهد بيلشتاين للنهوض بالعلوم الكيميائية.[1] تضع STRENDA معايير للنشر لبيانات نشاط الإنزيمات و STRENDA DB، وهو نظام إلكتروني للتحقق من صحة بيانات نشاط الأنزيم وتخزينها. وتأسست المؤسسة في عام 2004 نتيجة تحليل مُفصّل لنوعية البيانات الإنزيمية في المنشورات المكتوبة والإلكترونية.[2][3]
تقترح المبادئ التوجيهية[5] تلك المعلومات الدنيا اللازمة للإبلاغ الشامل عن البيانات الحركية والمتوازنة المستمدة من بحوث أنشطة الأنزيم بما في ذلك الظروف التجريبية المقابلة. يُقترح تناول هذه المعلومات الدنيا في منشور علمي عند الإبلاغ عن بيانات بحوث علم الأنزيمات لضمان وصف مجموعات البيانات بشكل شامل. يسمح هذا للعلماء ليس فقط بمراجعة البيانات وتفسيرها وتأكيدها ولكن أيضًا لإعادة استخدام البيانات لنمذجة ومحاكاة مسارات التحفيز الحيوي. إضافة إلى ذلك، تدعم المبادئ التوجيهية الباحثين لجعل بياناتهم التجريبية قابلة للتكرار وشفافة.[6][7][8][9]
STRENDA DB[13] عبارة عن منصة تخزين وبحث على شبكة الإنترنت تضمنت المبادئ التوجيهية وتتحقق تلقائيًا من البيانات المقدمة حول الامتثال لمبادئ STRENDA التوجيهية وبذلك ضمان اكتمال مجموعات بيانات المخطوطات وصلاحيتها. تمنح مجموعة بيانات صالحة رقم سجل STRENDA (SRN) ويتم إنشاء صحيفة وقائع (PDF) تحتوي على جميع البيانات المقدمة. يتم تسجيل كل مجموعة بيانات في Datacite وتعيين معرف الغرض الرقمي لإحالة البيانات وتتبعها. بعد نشر المخطوطة في مجلة تمت مراجعتها من قبل النظراء، أصبحت البيانات في STRENDA DB مفتوحة.[14][15] STRENDA DB هو مستودع أوصت به re3data و OpenDOAR. يتم حصاده بواسطة OpenAIRE. يوصى بخدمة قاعدة البيانات في تعليمات المؤلفين لأكثر من 10 مجلات للكيمياء الحيوية، بما في ذلك مجلة الكيمياء البيولوجية و eLife و PLoS. وقد أشير إليه كأداة موحدة للتحقق من صحة بيانات حركات الأنزيم وتخزينها في منشورات متعددة الجوانب.[16][17][18][19][20][21] كشفت دراسة حديثة تناولت أحد عشر منشوراً، بما في ذلك المعلومات الداعمة، من مجلتين رئيستين عن وجود إغفال واحد على الأقل في كل واحدة من هذه الورقات. وخلص المؤلفون إلى أن استخدام STRENDA DB في النسخة الحالية سيضمن إتاحة حوالي 80٪ من المعلومات ذات الصلة.[22]
إدارة البيانات
ويعدّ مَصْرِف STRENDA DB أداة لإدارة البيانات البحثية من قبل مجتمع البحوث (مثل مشروع الاتحاد الأوروبي CARBAFIN).[23]
^Kettner، Carsten؛ Hicks، Martin (1 يونيو 2005). "The Dilemma of Modern Functional Enzymology". Current Enzyme Inhibition. ج. 1 ع. 2: 171–181. DOI:10.2174/1573408054022234.
^Apweiler، Rolf؛ Armstrong، Richard؛ Bairoch، Amos؛ Cornish-Bowden، Athel؛ Halling، Peter J؛ Hofmeyr، Jan-Hendrik S؛ Kettner، Carsten؛ Leyh، Thomas S؛ Rohwer، Johann؛ Schomburg، Dietmar؛ Steinbeck، Christoph؛ Tipton، Keith (18 أكتوبر 2010). "A large-scale protein-function database". Nature Chemical Biology. ج. 6 ع. 11: 785. DOI:10.1038/nchembio.460. PMC:3245624. PMID:20956966.
^Swainston، Neil؛ Baici، Antonio؛ Bakker، Barbara M.؛ Cornish‐Bowden، Athel؛ Fitzpatrick، Paul F.؛ Halling، Peter؛ Leyh، Thomas S.؛ O'Donovan، Claire؛ Raushel، Frank M.؛ Reschel، Udo؛ Rohwer، Johann M.؛ Schnell، Santiago؛ Schomburg، Dietmar؛ Tipton، Keith F.؛ Tsai، Ming‐Daw؛ Westerhoff، Hans V.؛ Wittig، Ulrike؛ Wohlgemuth، Roland؛ Kettner، Carsten (23 مارس 2018). "STRENDA DB: enabling the validation and sharing of enzyme kinetics data". The FEBS Journal. ج. 285 ع. 12: 2193–2204. DOI:10.1111/febs.14427. PMC:6005732. PMID:29498804.
^Fademrecht, Silvia; Pleiss, Jürgen (2018). "Enzymmodellierung: von der Sequenz zum Substratkomplex". Einführung in die Enzymtechnologie (بالألمانية). Springer. pp. 35–51. DOI:10.1007/978-3-662-57619-9_3. ISBN:978-3-662-57619-9.
^Cornish-Bowden، Athel (2012). Fundamentals of enzyme kinetics (ط. 4th., rev. and enlarged). Wiley-VCH. ص. 413–450. ISBN:978-3-527-33074-4.
^Emmerich, Christoph H.; Harris, Christopher M. (2020). "Minimum Information and Quality Standards for Conducting, Reporting, and Organizing In Vitro Research". Good Research Practice in Non-Clinical Pharmacology and Biomedicine (بالإنجليزية). Springer International Publishing. Vol. 257. pp. 177–196. DOI:10.1007/164_2019_284. ISBN:978-3-030-33656-1. PMID:31628600. {{استشهاد بكتاب}}: |صحيفة= تُجوهل (help)
^Harmer, Nicholas J.; Vega, Mirella Vivoli (2019). "Reaction Chemical Kinetics in Biology". Biomolecular and Bioanalytical Techniques (بالإنجليزية). John Wiley & Sons, Ltd. pp. 179–217. DOI:10.1002/9781119483977.ch9. ISBN:978-1-119-48397-7. S2CID:133422670.
