الوظيفة الحيوية للقواعد النتروجينية هي ربط الأحماض النووية مع بعضها البعض. توجد في القاعدة النتروجينية ذرة نتروجين لها خواص قاعدية . وتنتسب الخواص القاعدية للقاعدة النتروجينية إلى أيون زوجي للكترونات في ذرة النتروجين.
تعتبر القواعد النتروجينية مشتقات من جزيئات أكبر منها: بيريميدينوبورين.
[1] البيريميدينات والبورينات ليست قطبية بسبب كونها مثلثة الشكل ومسطحة . وهي تشبه بيريدين، وهي لذلك قواعد ضعيفة.[2]
في علم الأحياء يغلب تسمية القاعدة النتروجينية قاعدة نووية، ذلك نظرا إلى دورها في الأحماض النووية - فأشكالها المسطحة هامة كلبنات لبناء الدناوالرنا. تشكل 5 من القواعد النتروجينية بنية النكليوتيد ات، التي بدورها تكوّن أحماضا نووية كبيرة مثل الدنا والرنا.
تلك القواعد النتروجينية هي: أدنين (A), يوراسيل (U) , غوانين (G), ثايمين (T), وسايتوسين (C). تلك القواعد النتروجينية ترتبط عن طريق رابطة هيدروجينية مع السلسلة المقابلة من جزيء الدنا مكونة الرابطات العرضية على «سلم» الحلزون المزدوج للدنا أو تعمل كمحفز حيوي مثل النوكليوتيدات. يرتبط الأدنين دائما بالثيامين، ويرتبط الغوانين دائما مع السايتوسين . وهم يسمون لذلك زوج قاعدة . أما اليوراسيل فهو يوجد فقط في الرنا ويحل محل الثيامين. البيريميدينات هي اليوراسيلوالثايمينوالسايتوسين. وكل منها له حلقة واحدة. كما وجدنا من القواعد النتروجينية ما له حلقتين، وهما الأدنين والغوانين، وهذان ينتميان إلى ما يسمى بورينات .
[3] (أنظر الشكل أسفله)
