El seu origen es remunta al segle xi, quan va ser fundada per pastors camerans i de Calahorra, després de la reconquesta d'aquesta pel rei Garcia IV Sanxes III de Navarra, el de Nájera, en 1045, va ser llogaret de Calahorra fins a independitzar-se en 1664, regnant Felip IV, mitjançant el pagament d'una considerable suma prestada pels frares de Fitero, monestir amb el qual va mantenir vincles. Després de molts plets, el que llavors s'anomenava Arnedo de Ebro passà a les mans de Manuel Íñiguez de Arnedo.