L'Audiència dels "Confines de Guatemala y Nicaragua" fou una divisió administrativa americana erigida per Reial Cèdula del 20 de novembre de 1542 junt amb la Reial Audiència de Lima; les dues noves audiències es van repartir la jurisdicció de l'audiència de Panama que havia estat suprimida. Inclogué les antigues governacions de Guatemala, Hondures, Chiapas i Nicaragua, que foren suprimides.
El 1552 es va restaurar la governació d'Hondures, el 1561 es va crear la de Soconusco, el 1565 es va restaurar la de Nicaragua i el 1574 es va crear la de Costa Rica.
La seva capital inicial fou Santiago, però es va establir el 13 de setembre de 1543 a la vila de Valladolid de Comayagua. En aquest mateix any es va ordenar la incorporació a l'audiència del Yucatán, però no es va fer efectiva fins que per Cèdula de 7 de juliol de 1550 Yucatán fou separada de l'Audiència de Mèxic i unida a la dels Confines. L'any 1544 la capital es va traslladar a Gracias a Dios (16 de maig de 1544) i per Cèdules de 25 d'octubre de 1548 i 1 de juny de 1549 es va establir a la ciutat de Santiago de Guatemala. Per Reial Cèdula de 20 de gener de 1553 li fou incorporada la província de Soconusco.
El 15 de gener de 1568 fou restablerta, però el Yucatán va passar definitivament a l'Audiència de Mèxic. Des de llavors ja fou coneguda com a Audiència de Guatemala.