Balta va començar la seva carrera a Alemanya, en equips de juvenils. El 2005 decideix traslladar-se a Turquia per jugar en el Vestel Manisaspor.
El 2007 fitxa pel club, el Galatasaray, equip que per fer-se amb la seva fitxa va haver de pagar 750.000 €, donar a un jugador (Ferhat Öztorun) i cedir a altres dos (Anıl Karaer i Aydın Yılmaz). Amb aquest club ha guanyat el títol de Lliga en la seva primera temporada.[1]
Va ser convocat per disputar l'Eurocopa d'Àustria i Suïssa de 2008. En aquesta competició el seu equip va realitzar un gran paper, arribant a semifinals. Hakan Balta va ser un fix en l'onze titular i va disputar tots els minuts d'aquest torneig.