Lloris va començar la seva carrera futbolística en les categories inferiors d'un equip de la seva ciutat natal, l'Ogc Niça. El 18 de març de 2006 debuta amb el primer equip contra el Stade Rennais Football Club i ho fa amb victòria (1-0). Aquell mateix any juga uns altres tres partits i arriba a la final de la Copa de la Lliga de França amb el seu equip, encara que el trofeu finalment el va guanyar l'AS Nancy. A l'any següent aconsegueix la titularitat a la porteria.
El 2008 fitxa pel l'Olympique de Lió, equip que va pagar 8,5 milions d'euros per aconseguir els seus serveis.[4]