La finalitat de l'entitat és contribuir a la modernització, a la millora i l'impuls de la competitivitat, al desenvolupament sostenible dels sectors agrari, alimentari, agroforestal, aqüícola i pesquer, i també dels directament o indirectament relacionats amb el proveïment d'aliments sans i de qualitat als consumidors finals; a la seguretat alimentària i a la transformació dels aliments, i, en general, a la millora del benestar i la salut de la població.[4]
La seu de l'IRTA i dels seus serveis corporatius es troba a la Torre Marimon, a Caldes de Montbui. Disposa de centres propis a Barcelona (IRTA Cabrils, IRTA-CReSA), Lleida (IRTA Fruitcentre, Estació Experimental de Lleida, IRTA Lleida Agrònoms, Granja Experimental d'Alcarràs), Tarragona (IRTA la Ràpita, IRTA Mas Bové, IRTA Amposta) i Girona (IRTA Monells i IRTA Mas Badia). A més, l'IRTA està consorciat amb el CRAG i el CREDA.[cal citació]
El 2021, el personal propi de l'Institut era format per 882 persones (26% personal R+D, 10,7% de doctorands).[cal citació] L'estructura científica de l'IRTA consta de 3 àrees de programes de recerca fonamentals: Indústries Agroalimentàries, Producció Vegetal i Producció Animal, amb un programa transversal d'Economia agroalimentària.[cal citació]