Se sap que, al menys des del període Jōmon, la zona ha estat habitada pels ainus. L'any 1858 l'explorador Takeshirō Matsuura, qui té un monument al municipi. El 1897 arriben a la zona un grup de persones procedent de la prefectura de Mie que funden el llogaret de Kami-Furano. El poble de Furano (on es trobava l'actual Kami-Furano) s'integra en la recentment creada subprefectura de Kamikawa el 1898. L'any 1899 s'estableix un petit ajuntament provisional a Kami-Furano i s'inaugura el ferrocarril entre Biei i Furano, obrint-se l'actual estació de Kami-Furano. Amb l'escissió el 1903 de l'actual ciutat de Furano es crea el poble de Kami-Furano. L'any 1948 comença el cultiu de la lavanda, un dels trets característics de la vila i de la regió de Kamikawa.[3] No fou fins al 1951 quan Kami-Furano va assolir la seua categoria actual de vila. L'any 1957 el municipi va oficialitzar els seus actuals símbols heràldics.[4]
Administració
Alcaldes
Els alcaldes de Kami-Furano són els següents. S'inclouen els alcaldes del llogaret i del poble abans de la declaració de vila:[5]