L'any 1479 amb la mort de la seva mare, la reina de Navarra Elionor, el seu nét Francesc Febus, encara menor d'edat, va pujar al tron sota la regència de la seva mare Magdalena de França. Magdalena de França va mantenir la regència amb fermesa, resistint la pressió de les corts de França i Castella que van intentar que Francesc es casés amb una de les princeses de les seves respectives cases reials. Les pressions exercides pel rei d'Aragó i rei consort de Castella, Ferran II, van ser moltes, també perquè una part dels nobles navarresos li van donar suport i, entre 1480 i 1481, es va produir quasi una guerra civil, que va ser frustrat per la intervenció del cardenal Pere de Foix, oncle de Francesc Febus i nebot de Ferran II. Pere va aconseguir negociar i posar pau entre els dos bàndols.