Vlajka Guatemaly je tvořena listem o poměru stran 5:8 se třemi vertikálními pruhy – světle modrým, bílým a světle modrým. Uprostřed státní vlajky, v bílém pruhu, je znak z roku 1997 (základ znaku je ale již z roku 1871). Je na něm v přirozených barvách quetzal (Kvesal chocholatý, guatemalský národní pták z řádu trogonů), symbolizující svobodu, který svírá pergamenový svitek s textem LIBERTAD 15 DE SEPTIEMBRE DE 1821 (Svoboda a den vyhlášení nezávislosti na Španělsku). Za ním jsou zkřížené pušky značky Remington s nasazenými bodáky a zkřížené šavle uvnitř vavřínového věnce.[1][2]
Po pádu císařství se začaly vyvěšovat neoficiální vlajky: modro-bílo-modré vlajky s horizontálními pruhy. 1. července 1823 vyhlásila Guatemala znovu nezávislost na Mexiku a vytvořila základ Spojených provincií Střední Ameriky (konfederace byla oficiálně založena 10. července). Vlajkou konfederace se stal 21. srpna list s třemi vodorovnými pruhy: modrým, bílým a modrým (pravděpodobně o poměru stran 3:5), a znakem Spojených středoamerických provincií uprostřed, v kruhovém poli.[2]
22. listopadu1824 byl název konfederace změněn na Federativní republika Střední Ameriky (ve zdroji Středoamerická spolková republika); oficiálně vyhlášena byla 10. dubna1825. Na státní vlajce o poměru stran 3:5 se změnil pouze státní znak, nyní v oválném poli.[2]
13. dubna1839 Guatemala z federace vystoupila a vytvořila nezávislý stát. V této souvislosti byla změněna vlajka, ale zase pouhou změnou znaku na vlajce s modro-bílo-modrými, horizontálními pruhy. 26. října1843 byl změněn státní znak a tato změna se zároveň promítla i na novou vlajku.[2]
Po nástupu prezidenta Mariana Paredese do funkce 1. ledna1849, navrhl kongres změnit státní symboly (včetně vlajky) tak, aby symbolizovaly dobré vztahy se Španělskem. Nová vlajka byla schválena a zavedena 14. března1851. Vlajku tvořily tři, stejně široké pruhy. Prostřední celý v bílé barvě a krajní rozděleny na polovinu v žerďové a vlající části. Horní červený v žerďové a modrý ve vlající části a dolní ve žluté a modré barvě. Uprostřed bílého pruhu byl na státní vlajce umístěn státní znak.[2]
31. května1858 byla nezvykle řešená vlajka změněna. Novou vlajku o poměru stran 2:3 tvořilo sedm horizontálních pruhů v poměru šířek 1:1:1:3:1:1:1 v barvách (odshora) modrá-bílá-červená-žlutá-červená-bílá-modrá. Uprostřed listu byl na státní vlajce umístěn státní znak.[2]
17. srpna1871 zavedl guatemalský prezident, generál Miguel García Granados dekretem č. 12 novou národní vlajku, která tři měsíce plnila i funkci státní vlajky. Vlajku tvořily tři, stejně široké vertikální pruhy: světle modrý, bílý a světle modrý. 18. listopadu byla dekretem č. 33 zavedena státní vlajka, přidáním znaku ve světle modrém štítu doprostřed vlajky (zobrazená vlajka má světlejší odstín). Tato podoba vlajky se užívala do roku 1900, ale dle některých zdrojů až do roku 1926. Poté byl modrý štít pod znakem odstraněn.[2]
12. září1968 došlo k zatím poslední změně vlajky. Poměr stran se změnil na 5:8, odstín modrých pruhů byl změněn na světlejší a znak byl zmenšen. Na znaku byly zaměněny ratolesti kávovníku za vavřín a odstraněna byla i modrobílá stužka, která je svazovala.
26. prosince1997 došlo k poslední změně znaku, a tím i státní vlajky. Quetzal od té doby hledí heraldicky vpravo a slovo setiembre se změnilo na septiembre (dosud se psal název měsíce září bez písmena P).
Guatemalská vlajka (1839–1843) Poměr stran: 3:5, zobrazeno 2:3
Guatemalská vlajka (1843–1851) Poměr stran: pravděpodobně 3:5, zobrazeno 2:3
Guatemalská státní vlajka (1851–1858) Poměr stran: pravděpodobně 3:5, zobrazeno 2:3
Guatemalská národní vlajka (1851–1858) Poměr stran: pravděpodobně 3:5, zobrazeno 2:3
Guatemalská státní vlajka (1858–1871) Poměr stran: 2:3, zobrazeno 1:2
Guatemalská národní vlajka (1858–1871) Poměr stran: 2:3, zobrazeno 1:2
Guatemalská národní vlajka (1871–1968) Poměr stran: 2:3, zobrazen jiný poměr
Guatemalská národní vlajka (1871–~1900/1926); oproti zdroji světlejší Poměr stran: 2:3
Guatemalská státní vlajka (~1900/1926–1968) Poměr stran: 2:3, zobrazen jiný poměr
Vlajky bývalých členů Spojených provincií
Vlajky bývalých členů Spojených provincií Střední Ameriky, ke kterým Guatemala v letech 1823–1839 patřila, mají dodnes podobný design. Dominují jim modré a bíle pruhy, na rozdíl od guatemalské vlajky však horizontální.