Faaborg Værft A/S er et danskskibsværft. Værftet, som blev etableret i 1970, er beliggende i Faaborg. Værftet udfører blandt andet reparation, vedligeholdelse og nybygning af komposit fartøjer. Værftet hed indtil 1985Faaborg Yachtværft. I begyndelsen var produktionen baseret på lystbåde i glasfiberarmeretpolyester, men gennem tiden fik værftet en stadig stigende produktion af fiske- og specialfartøjer, som hurtigt kom til også at omfatte erhvervsfartøjer.
Historie
1970 – Faaborg Yachtværft bliver grundlagt.
1979 – Faaborg Yachtværft overtager Jupiter Værftet på Bogø ved Møn, og får derved også fat i rettighederne til at bygge Jupiter både.
1979 – Produktionen af Jupiter bådene flyttes til Faaborg.