Kléberson nåede i sin tid som landsholdsspiller (2002-2010) at spille 32 kampe og score 2 mål for Brasiliens landshold. Han fik sin debut den 31. januar 2002 i en kamp mod Bolivia. Han var med til at vinde guld ved VM i 2002 i Sydkorea/Japan, og deltog også ved VM i 2010 i Sydafrika.