In Nebraska leitete er 25 Jahre geologisch-paläontologische Grabungsexkursionen, Morrill Geological Expeditions genannt nach Charles Henry Morrill, der sie finanzierte. Ihre Berichte erschienen in den Abhandlungen des Nebraska Geological Survey.
Er fand und beschrieb zahlreiche fossile Elefanten (ausgestellt in der Morrill Hall des Museums, auch Elephant Hall genannt) und erforschte deren Evolution.
1887 heiratete er Margaret Lamson, er hatte mit ihr eine Tochter.