Freddie Prinze junior ist der einzige Sohn des amerikanischen Schauspielers und Komikers Freddie Prinze, der im Januar 1977 an einer selbst beigebrachten Schussverletzung starb. Nach dem Tod seines Vaters wuchs er in Albuquerque im Bundesstaat New Mexico auf. Nach seinem High-School-Abschluss 1994 zog er zurück nach Los Angeles. Seit dem Jahr 2002 ist Prinze mit der Schauspielerin Sarah Michelle Gellar verheiratet. Im September 2009 bekam das Paar eine Tochter und im September 2012 einen Sohn.
Nach einigen kleineren Fernsehauftritten spielte er 1996 in dem Liebesdrama Schatten einer Liebe mit Michelle Pfeiffer und Claire Danes. Seinen endgültigen Durchbruch schaffte er 1997 als Ray Bronson mit Ich weiß, was du letzten Sommer getan hast, in dem auch Jennifer Love Hewitt und seine spätere Frau Sarah Michelle Gellar mitwirkten. Seit 2004 hat er Gastauftritte in David E. Kelleys erfolgreicher Anwaltsserie Boston Legal. Er spielt dort Donny Crane. Im Jahr 2009 stand er für Dreharbeiten zur Echtzeitserie 24 in der Rolle des Cole Ortiz vor der Kamera. Ab Oktober 2014 leiht er im englischen Original dem Jedi Kanan aus der animierten Serie Star Wars Rebels seine Stimme.
2008 verstärkte er das Kreativteam von World Wrestling Entertainment (WWE). Prinze ist ein erklärter Wrestling-Fan und hatte in diesem Jahr schon einige Berührungen mit der Liga: Er war bei WrestleMania im Publikum, bei der Hall-of-Fame-Zeremonie, hatte einen Gastauftritt im „Dirt Sheet“ von John Morrison und The Miz und bloggte für „Fan Nation“, die Social-Networking-Seite der WWE. Am 17. August 2009 hatte er einen Gastauftritt bei RAW, wobei er den General Manager von Monday Night Raw spielte.
Im Jahr 2016 veröffentlichte er mit Back To The Kitchen ein Kochbuch.[2]
