Gegründet wurde die Liga 2008 mit dem Ziel, die Jugendmannschaften unter Profibedingungen zu fördern. Die Liga startete 2008 mit 8 Jugendmannschaften und ist bis 2018 auf alle 24 K-League-Jugendvereine angewachsen. Von 2008 bis 2014 wurden die Spielzeiten in Hin- und Rückrunde ausgetragen. Dabei nahmen die besten 6 Mannschaften der K League Junior jährlich am A-Jugend-Vereinspokal teil. 2015 wurde der Ligamodus in eine aufgeteilte Hin- und Rückrunde durchgeführt, an der die besten 8 Mannschaften der Liga, am A-Jugend-Vereinspokal teilnehmen.
Von 2008 bis 2011 war SBS der Ligasponsor und die Liga nannte sich in dem Zeitraum SBS High School Club Challenge League. Seit 2012 sponsert Adidas die Liga und von 2012 bis 2013 hieß die Liga Adidas All In Challenge League. 2014 wurde die Liga in K League Junior umbenannt und trägt seitdem mit Adidas als Ligasponsor den Namen Adidas K League Junior.