Magowan ist eine Absolventin des Londoner The Actors Institute. Ihr Bühnendebüt gab sie in der Produktion Top Girls von Caryl Churchill.
Magowan heiratete im April 2004 ihren Landsmann und Schauspielkollegen John Simm im Forest of Dean in der GrafschaftGloucestershire. Das Paar hat einen Sohn (* 2001) und eine Tochter (* 2007). Magowan und Simm hatten gemeinsame Auftritte in mehreren Filmen wie 24 Hour Party People (2002) oder dem preisgekrönten KurzfilmDevilwood (2006).[1]