Der Sohn einer Holzhändlerfamilie studierte in Wien an der Hochschule für Welthandel Wirtschaftswissenschaften und wurde 1957 für drei Jahre Vorsitzender der Österreichischen Hochschülerschaft an der Hochschule. 1958 erwarb er sein Diplom, die Promotion folgte 1961. Wallner war Mitglied der katholischen Mittelschulverbindung Ostarrichia Amstetten im MKV sowie der katholischen Studentenverbindung Danubia Wien im ÖCV.
Im Jahr 1964 wurde er zum wirtschaftspolitischen Berater des damaligen Bundeskanzlers Josef Klaus ernannt. Vier Jahre später (1968) übernahm er als Generaldirektor die Casinos Austria AG und baute diese zu einem der größten Unternehmen dieser Branche weltweit aus. Im Mai 2007 ging er als Generaldirektor in Pension, blieb aber als Vizepräsident im Aufsichtsrat dem Unternehmen erhalten. Sein Nachfolger als Generaldirektor wurde Karl Stoss.
In erster Ehe war er mit der Medizinerin Christine Wallner verheiratet, mit der er zwei Kinder hatte.[5] Später war er mit der Kammersängerin Elisabeth Kales-Wallner verheiratet, die 2005 an Krebs verstarb.
