Karantinos studierte Architektur in Athen. Nach Beendigung seines Studiums ging er nach Frankreich und arbeitete in Paris für Auguste Perret. Er sah die Architektur in einer ganzheitlichen sozialen Verantwortung. Seine Werke sind deshalb vor allem öffentliche Bauten. Hervorzuheben sind die Archäologischen Museen Iraklio (1933) und Thessaloniki (1960). Eine besondere Rolle nimmt bei seinen Werken das Licht ein. Befreundet war er seit seinem Militärdienst mit dem späteren Bildhauer George Zongolopoulos, sie arbeiteten auch zusammen.
Im Jahr 1928 wurde vom griechischen Erziehungsministerium unter der Regierung Venizelos das groß angelegte Schulbauprogramm (griechischΠρόγραμμα Σχολικών Κτιρίων) ins Leben gerufen mit dem Ziel, Schulbauten nach neuen Erkenntnissen zu planen und zu errichten. Karantinos wurde zum Direktor der Kommission ernannt. Alle Bauten wurden in der Formensprache der klassischen Moderne ausgeführt. Sie zeichnen sich durch eine geometrische Form und lange durchgehende Fensterbänder aus. Als Bekenntnis zum Fortschritt wurden die Schulgebäude das architektonische Aushängeschild des Landes, sie wurden auch auf vielen Ausstellungen gezeigt.
1933 nahm er als Vertreter Griechenlands am CIAM-Kongress teil und war wesentlich an der Ausarbeitung der Charta von Athen beteiligt.
In Konflikt mit der diktatorischen Regierung von Ioannis Metaxas (die seiner Architektur ablehnend gegenüberstand), löste Karantinos 1936 die Kommission des Schulbauprogramms auf. 1937 ernannte ihn das Royal Institute of British Architects (RIBA) zum Ehrenmitglied.
Nach dem Krieg nahm Karantinos von 1959 bis 1968 eine Professur an der Aristoteles-Universität Thessaloniki an, dort wirkte er mit seinen Studenten an einer Neuordnung des Unicampus und der Errichtung zahlreicher neuer Gebäude. 1960 baute er das Archäologische Museum der Stadt. Nach dem Putsch der Militärjunta 1967 widersetzte sich Karantinos öffentlich den neuen Machthabern, so dass er ein Jahr später vom Dienst suspendiert wurde. Mit dem Fall der Junta wurde Karantinos 1974 rehabilitiert, er trat seine Ämter jedoch nicht mehr an, da er sich zu Ruhe setzen wollte.
Werke (Auswahl)
Bauten des Schulbauprogramms 1928–1936, beispielsweise:
Grundschule Kalisperi-Straße 138 in Athen, 1931[1]
Die Qualität des Werks von Karantinos ist sehr unterschiedlich. Bauten wie das Archäologische Museum in Thessaloniki oder die Grundschule in Ermoupolis auf Syros waren ihrer Zeit voraus und sind bis heute viel beachtet. Auch die Bauten des Schulprogramms werden gepflegt und geschätzt (nicht zuletzt aufgrund der Prominenz des Architekten). Im Gegensatz dazu stehen einige Spätwerke. So steht zwar das (leer stehende) Erziehungsministerium in der Mitropoleos-Straße in Athen unter Denkmalschutz, findet jedoch wenig Beachtung, ebenso wie einige Museen, die entweder bereits umgebaut (Archäologisches Museum Delphi) oder aufgegeben wurden (Akropolis-Museum, nach Einweihung des Neubaus von Bernard Tschumi).