Dieser Flug war eine Mission zur ISS und der 24. bemannte Flug zu dieser Station. Die auf der Raumstation arbeitende Expedition 8 wurde durch die Mannschaft der Expedition 9 abgelöst. Sie bestand aus dem russischen Kosmonauten Gennadi Padalka (Kommandant) und dem US-Amerikaner Edward Fincke (Bordingenieur). Zusätzlich flog der niederländischeESA-Astronaut André Kuipers mit, der nach einem kurzen Stationsaufenthalt am 30. April 2004 mit der Sojus TMA-3-Landekapsel zur Erde zurückkehrte.
Die beiden Raumfahrer Padalka und Fincke arbeiteten als 9. Stammbesatzung auf der ISS und führten wissenschaftliche Experimente durch. Außerdem erhielten sie Nachschub durch zwei Progress-Raumtransporter.