En su primer año el equipo participó en la Tercera División de la Asociación del Fútbol de Pando, torneo del que salió campeón y el mismo año ascendió a la Segunda División.[3]
El hecho de ascender trajo consigo la necesidad de mayor organización, e involucró el apoyo de las autoridades de la Universidad Amazónica de Pando.
La participación del equipo en Segunda categoría, la Primera B, fue también de éxito, pues el equipo había logrado jerarquizar a su plantel y contar con futbolistas talentosos de la misma universidad, por lo que logró un ascenso también histórico a Primera A. Paralelo a ello, los jugadores y fundadores del club egresaron de la misma universidad. Además, el club fue retomado por otros estudiantes y por la misma Universidad.
Paralelamente, y durante varios años, fue un tema de discusión el hecho de incluir al Departamento de Pando en la Primera División de Bolivia de otra manera que no sea por mérito deportivo.[4]
Fue hasta que finalmente el jaguar pandino realizó una campaña casi perfecta en el Campeonato Nacional B 2013/14; durante el campeonato jugó 18 partidos, de los cuales sólo perdió 1. En el último partido ganó por 3-1 al Club Empresa Minera Huanuni y se aseguró el primer puesto del campeonato, logrando así su ascenso a Primera División.
El 2020 luego de siete años el club volvió a clasificarse a la Copa Simón Bolívar.
A Universitario de Pando se le conoce como el Jaguar Pandino por pertenecer a la región oriental de Bolivia. La mascota del club es el "Jaguar".
Canción oficial
La canción oficial del club Universitario de Pando, fue escrita por el canto autor Pandino Smiker Coelho y se titula "Ruge Jaguar".
Uniforme
Uniforme titular: Camiseta amarilla con detalles verdes, pantalón verde y medias verdes.
Uniforme alternativo: Camiseta roja con detalles azules, pantalón verde y medias rojas.
Titular
Visitante
Instalaciones
Al ser administrado por la Universidad Amazónica de Pando, el equipo juega de local en el campus universitario que posee una capacidad aproximada para 4 000 espectadores y en el cual disputó sus partidos en la liga.[5]
Durante sus partidos en la Copa Simón Bolívar, jugó en el Estadio Leopoldo Fernández de la localidad de Porvenir, cerca de Cobija.
Hinchada
Barras organizadas
La «Garra Amazónica» es como se denomina a la barra brava oficial del club, está compuesta por estudiantes de esa misma casa de estudios.
Rivalidades
Clásico estudiantil
El denominado «Clásico estudiantil» fue el partido que enfrentó a Universitario de Pando con Universitario de Sucre en la liga profesional.
Rivalidad con Vaca Díez
A nivel regional Universitario mantiene una gran rivalidad con Vaca Díez.
↑Debido a que no existe una Segunda División de fútbol en Bolivia, un club desciende directamente a su asociación departamental, la tercera división.Su jugador más joven debutado fue Luis Fabricio Salazar Hurtado con 14 años el nacido en 2009 debutó en la ida contra el club Deportivo San José en la ida de los octavos de final de la Copa simon Bolivar.A final de año el campeón y subcampeón de su asociación se clasifica a la Copa Simón Bolívar en la que el campeón asciende a la liga de Primera División.
