El enlace C-N que une a dos aminoácidos es más corto que otros enlaces C-N
El enlace C-N presenta carácter parcial de doble enlace ya que se estabiliza por resonancia, lo que no permite el giro en dicho enlace.Sin embargo, el resto de los enlaces (N-C y C-C) son enlaces sencillos verdaderos, con lo que podrÃa haber giro (señalado con a en la imagen).[4]
Los cuatro átomos del enlace (CO-NH) se hallan en un mismo plano, con el OxÃgeno y el Hidrógeno en posición trans.
Si denominamos "Φ" al valor del ángulo que puede adoptar el enlace N-C, y "Ψ" al del enlace C-C, solo existirán unos valores permitidos para Φ y Ψ (ver gráfico de Ramachandran); y dependerá en gran medida del tamaño y caracterÃsticas de los grupos R sucesivos.
El enlace peptÃdico puede romperse por hidrólisis (añadiendo agua). En su presencia se romperá liberando 8–16 kilojulios/mol (2–4 kcal/mol) de energÃa libre. En la naturaleza este proceso es extremadamente lento (más de 1000 años), pero hay formas de acelerarlo:
Hidrólisis básica: Respeta los aminoácidos que se destruyen por la hidrólisis anterior. Normalmente se utiliza NaOH o Ba(OH)2.
Hidrólisis enzimática: Es la forma más común en los seres vivos, se utilizan enzimas proteolÃticas cuya actividad es lenta y a menudo incompleta, sin embargo no se produce racemización y no se destruyen los aminoácidos; por lo tanto es muy especÃfica. Las enzimas tripsina y quimotripsina, presentes en los jugos digestivos, son ejemplos de enzimas proteolÃticas.
Hidrólisis por temperatura:[Nota 1] en condiciones normales, la alta temperatura no destruye los enlaces peptÃdicos, aunque sà puede llegar a desnaturalizar la proteÃna (ruptura de las estructuras secundaria, terciaria y cuaternaria). Sin embargo, temperaturas extremas aplicadas un largo tiempo pueden llegar a destruir los enlaces peptÃdicos (>110 grados 48 h).