De 1797 a 1815, Saicourt perteneció a Francia, la comuna formaba parte del departamento de Monte Terrible, y a partir de 1800, del departamento del Alto Rin, al cual el departamento de Monte Terrible fue anexado. En 1815, después del Congreso de Viena, el territorio del antiguo Obispado de Basilea fue atribuido al cantón de Berna.
Actualmente la comuna forma parte de la región del Jura bernés, la parte francófona del cantón de Berna.
