Hänet valittiin parlamenttiin Buenos Airesista vuonna 2000 Fernando de la Rúan hallituksen talousministeri Domingo Cavallon johtaman Acción por la República -puolueen edustajana. Hän jätti paikkansa parlamentissa 2003 ryhtyessään Kirchnerin hallituksen pääministeriksi.
Alberto Fernández aloitti Argentiinan presidenttinä joulukuussa 2019 voitettuaan presidentinvaalit lokakuussa. Fernandezin varapresidenttinä aloitti entinen presidentti Cristina Fernandez de Kirchner.[1] Fernández on ilmoittanut, ettei aio pyrkiä presidenttinä jatkokaudelle.[2]