El Greco -museo (kreik.Μουσείο Ελ Γκρέκο, Mouseío El Gkréko; myös Μουσείο Δομήνικου Θεοτοκόπουλου, Mouseío Domínikou Theotokópoulou) on museoFódelen kylässä Kreetan saarella Kreikassa. Se esittelee kylästä kotoisin olleen taidemaalari El Grecon (1541–1614) elämää ja taidetta.[1][2]
Museo avautui yleisölle vuonna 1998. Se sijaitsee noin kilometrin Fódelen kylän keskustasta luoteeseen ja toimii rakennuksessa, jota väitetään El Grecon kotitaloksi. Museossa ei ole El Grecon aitoja teoksia, vaan hänen taidettaan esitellään kopioiden kautta.[1][2] Kreetan ainoat aidot El Grecon teokset ovat Kreetan historiallisessa museossaIraklionissa.