Janni Thomsen (s. 16. heinäkuuta 2000) on tanskalainen jalkapalloilija, pelipaikaltaan keskikenttäpelaaja. Hän on pelannut Tanskan naisten maajoukkueessa kesäkuun 2022 loppuun mennessä 15 maaottelua ja tehnyt niissä kolme maalia, yhden maaliskuussa 2020 Algarve Cupin ottelussa Belgiaa, yhden huhtikuussa 2022 MM-karsintaottelussa Maltaa ja yhden kesäkuussa 2022 ystävyysottelussa Brasiliaa vastaan.[1] Brasilia-ottelu oli Tanskan naismaajoukkueen ensimmäinen Parkenilla pelaama maaottelu ja Thomsenin tekemä maali joukkueen ensimmäinen tuolla stadionilla.[2] Ensimmäisen maaottelunsa Thomsen pelasi maaliskuussa 2020 Algarve Cupissa Norjaa vastaan.[1]
Thomsen on edustanut seuratasolla kotimaassaan VSK Aarhusia ja heinäkuusta 2020 alkaen Norjassa Vålerengaa.[1]
Lähteet