Japanin ralli oli ensimmäisen kerran mukana rallin MM-sarjassa vuonna 2004 ja järjestettiin vuoteen 2007 saakka Hokkaidōn saarella Tokachi-Obihiron alueella. Vuosina 2008 ja 2010 (kilpailua ei järjestetty vuonna 2009) keskuspaikkana oli Sapporo.[1] Kilpailu oli soraralli, joka ajettiin kapeilla metsäteillä.
Japanin ralli ei kuulunut rallin MM-sarjan kilpailuohjelmaan vuosina 2009 ja 2011–2019. Kilpailun oli tarkoitus tehdä paluu MM-sarjaan kaudella 2019, mutta kausi päätettiin järjestää 14 kilpailun pituisena 15 kilpailun sijaan kustannussyistä.[2][3] Myöhemmin paluuta aiottiin kaudella 2020 ja kaudella 2021, mutta molempina vuosina kilpailu jouduttiin perumaan koronaviruspandemian vuoksi. Paluu viivästyi lopulta kaudelle 2022.[4]
Kaudelle 2022 ralli siirrettiin Hokkaidōsta Honshūn asfalttiteille Nagoyan ympäristöön.[5] Huoltoalue on Toyotassa.[1]
Lokakuussa 2024 kerrottiin, että rallia ajetaan Toyota Cityn lähistöllä Aichin ja Gifun prefektuureissa ainakin vuoteen saakka 2028 ulottuvalla sopimuksella.[6]