Prodin komissio oli kymmenes Euroopan komissio, joka aloitti toimikautensa syyskuussa 1999. Komission puheenjohtajana toimi Italian entinen pääministeri Romano Prodi.
Prodin komissiota edelsi Jacques Santerin komissio, joka joutui eroamaan 15. maaliskuuta1999 komission toimintaan liittyvien väärinkäytösepäilyjen takia. Santerin komissioon liittynyt skandaali vahingoitti merkittävästi Euroopan komission mainetta. Tapaus varjosti myös Prodin komission alkukautta. Santerin skandaalikomissiota seurasi Manuel Marínin väliaikainen komissio, joka toimi Prodin hallintokauden aloituspäivään saakka.
Alkujaan kommissio koostui kahdestakymmenestä komissaarista. Euroopan unionin laajentumisen jälkeen vuonna 2004 komissaarien määrä nousi kahteenkymmeneenviiteen. Prodin komissio oli viimeinen komissio, jossa suurille jäsenmaille (Italia, Ranska, Saksa, Espanja ja Iso-Britannia) oli myönnetty kaksi komissaarinsalkkua.
Prodin kaudella Euroopassa otettiin käyttöön yhteisvaluutta euro. Euro toimi
tilivaluuttana 1. tammikuuta 1999 alkaen ja käteisvaluuttana kahdessatoista EU-maassa 1. tammikuuta 2002 lähtien.[3] Euron käyttöönottoa seurasi kolmen vuoden siirtymäaika.
Prodin toimikaudella allekirjoitettiin myös Nizzan sopimus, jonka pääasiallisena tarkoituksena oli uudistaa toimielinten rakennetta kestämään Euroopan unionin laajentuminen. Nizzan sopimus astui voimaan 1. helmikuuta2003.
Merkittävistä uudistuksista huolimatta Prodin hallintokautta on kritisoitu mitäänsanomattomaksi ja sen on usein katsottu epäonnistuneen suurissa linjauksissaan.[4]