À l'âge de 18 ans, Agathe Yi Kan-nan se marie, mais son mari meurt deux ans après. En 1834, elle entend parler de la religion catholique. Elle ne veut pas se remarier, et demandé à sa mère de lui faire rencontrer une catholique. Ce n'était pas difficile car il y a une catholique dans sa famille. La catholique de la famille enseigne le christianisme à Agathe, à sa mère et à son frère. Ils sont tous les trois baptisés par un prêtre venu de Chine, le père Pacifique Yu[1].
Mais le père d'Agathe est un païen endurci, fâché d'apprendre que sa famille a été baptisée. Il envoie Agathe dans la famille de son défunt mari, et il envoie son épouse et son fils dans la province de Gyeongsang. Agathe obéit à son père et part dans la famille de son mari décédé ; elle s'y montre très gentille avec toute la famille. Les membres de la famille sont heureux qu'une de leurs belles-sœurs soit devenue catholique[1].
Ayant économisé de l'argent, Agatha achète une maison où elle vit avec ses amis. Elle est très pieuse et jeûne souvent. Les catholiques l'admirent et disent qu'elle est aussi claire qu'un miroir et aussi pure que la neige[1].
Agathe Yi Kan-nan est une des quatre femmes arrêtées dans la maison de Charles Hyon le . Elle passe plus de deux mois en prison. Elle est soumise à la torture, mais elle refuse de renier sa foi. Le , elle meurt sous les coups ou étranglée, à l'âge de trente-trois ans[1].
Sainte Agathe Yi Kan-nan est fêtée le 20 septembre, qui est à la fois le jour anniversaire de sa mort, et la date commune de célébration des martyrs de Corée[2].
