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Charles Dominique Joseph Bouligny naquit au sein d'une famille de notables louisianais. Son père, Francisco Bouligny (1736-1800), né à Alicante, était le frère de Jean Bouligny (Juan Bouligny) ambassadeur d'Espagne à Constantinople. Son père Jean Bouligny était marié avec Marie Paret.
Sa mère, Marie-Louise Le Sénéchal d'Auberville (1750-1834), était une descendante des premiers colons canadiens français installés en Louisiane française à l'époque de la Nouvelle-France.
Charles Dominique Joseph Bouligny fut éduqué par des précepteurs privés puis il étudia le Droit. Il servit comme enseigne dans le régiment espagnol de son père. Il devint commissaire du conseil municipal en 1800.
En 1807, il fut nommé juge de paix à La Nouvelle-Orléans.
Il siégea au comité de la défense publique lors de l'invasion britannique en 1814 et 1815.
Il a été élu au Sénat des États-Unis pour combler la vacance causée par la démission de Henry Johnson et demeura sénateur du 19 novembre 1824 au 3 mars 1829.
