Comme la quasi-totalité des économistes de l'université de Heidelberg, Lederer fut suspendu par les nazis le , en vertu de loi sur la restauration de la fonction publique, jusqu'à ce qu'une décision finale fût prise. Les membres de l'université durent aider les nazis en leur apportant des informations sur Emil Lederer s'ils voulaient rester libres et devenir membre du NSDAP.
Lederer réussi à s'échapper à Londres pour enfin arriver aux États-Unis, où il co-fonda « l'université en exil » de la New School for Social Research à New York. Il en fut le premier doyen jusqu'à sa mort survenue en 1939, à 56 ans, à la suite d'une intervention chirurgicale.
Œuvres
Aucun ouvrage de Lederer n'a été traduit en français.
Die Veränderungen im Klassenaufbau während des Krieges ("Les changements dans la construction de classe pendant la guerre"), 1918
Die Soziologie der Gewalt ("Sociologie de la violence"), 1919
Grundzüge der ökonomischen Theorie ("Caractéristiques de la théorie économique"), 1922
Technischer Fortschritt und Arbeitslosigkeit ("Progrès technique et chômage"), 1931
(en) The state of the masses ("L'état des masses"), 1939
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