La frontière est définie par l'administration coloniale française, pour laquelle ce n'était qu'une limite administrative interne de l'Afrique-Occidentale française. Une première fois en 1919, après que la Haute-Volta est détachée du Haut-Sénégal. Une seconde fois lorsque, après son démembrement en 1932, elle est recréée en 1947.
Le tracé de sa portion orientale a fait l'objet d'un contentieux entre les deux pays, qui s'est notamment traduit par des escarmouches frontalières en 1974 et la guerre de la Bande d'Agacher en 1985 ; il est définitivement établi par un arrêt de la Cour internationale de justice rendu le qui partage le territoire disputé de façon presque égale[1].
Hien (Pierre Claver) [1996], Le Jeu des frontières en Afrique occidentale, cent ans de situations conflictuelles au Burkina Faso actuel (1886-1986), thèse d'histoire sous la direction de Jean-Pierre Chrétien, Paris I, 496 p.
