Goitia arrive dans l'équipe B du Málaga CF pendant la saison 2003-2004, durant laquelle il joue 20 matchs. La saison suivante, il s'améliore à son poste pour disputer finalement 36 rencontres.
Lors de la saison 2005-2006, malgré l'ascension de l'équipe première, il ne profite des rares opportunités qui lui sont offertes, et est relégué sur le banc, en tant que second gardien.
Il signe à l'été 2009 en faveur du Betis Séville, tout juste relégué en Segunda División.
