Lee Jong Hyun a une sœur aînée. Il a vécu une partie de son enfance à Busan, mais à l'âge de quatre ans, ses parents décident de partir vivre au Japon. Quelque temps après, sa famille retourne vivre définitivement à Busan, où il a fini ses études au collège et au lycée. Lee rencontre Jung Yong Hwa à Séoul lorsqu’il rejoint la FNC Music, pour ensuite apprendre à jouer de la guitare basse à F&C Academy.
Lee Jong Hyun a composé plusieurs chansons, notamment pour son groupe, CN Blue. Comme il n'est plus le leader, on le considère actuellement comme le guitariste principal du boys band.
Carrière d'acteur
En 2010 il décroche un rôle au cinéma, celui de Kim Seong Won dans le film à sketchsAcoustic, avec un de ses partenaires de CN Blue, Kang Min Hyuk, qui interprète son frère, Kim Hae Won, dans la seconde partie du film intitulée « Bakery Attack ». Le film est sorti le en Corée du Sud. Le long métrage raconte l'histoire de deux frères sans argent qui sont passionnés par la musique. Ils réussissent plus tard à entrer à l'Université de Hongik.
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