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Né dans une famille de confession juive, son père meurt en 1912 quelques mois avant sa grande sœur. La famille déménage et c'est à Saint-Gall que Willy Guggenheim poursuit ses études et fait un apprentissage en lithographie. En 1921, il intègre l'École nationale des arts appliqués de Berlin.
Des revers de fortune de sa mère l'obligent à prendre un travail. Il entre alors chez Risacher au Faubourg Montmartre, puis il réalise des dessins humoristiques pour des journaux, qu'il exposera ensuite au Salon des humoristes. Il loue un studio rue de Vanves à Paris.
Le tableau "Die Heilsarmee" (Armée du salut) dans la maison de Friedrich Dürrenmatt à Neuchâtel ; Dürrenmatt et Eugène Ionesco assis sur le canapé.
En 1927, il fait la connaissance de Léopold Zborowski, découvreur de talents et marchand de tableaux, qui compte Chaïm Soutine et Amedeo Modigliani parmi ses protégés. Il lui signe un contrat et l'installe dans un atelier de La Ruche.
À la mort de Zborowski son mécène, en 1932, il quitte la France et rentre à Zurich où il gagne un concours pictural organisé par la ville qui lui attribue un atelier dans le pavillon rococo de Beckenhof, qu'il représentera dans ses œuvres au cours des huit années où il y demeura. En 1951, il fait la connaissance de Franca Giovanoli, qui deviendra son épouse en 1963. En 1933, il rencontre Wilfrid Moser qu'il invite à exposer avec lui.
Il se lie d'amitié avec Friedrich Dürrenmatt, dont il fera plusieurs portraits. Celui-ci collectionnera les œuvres de son ami et lui écrira les préfaces de ses catalogues d'expositions ainsi que sa biographie[1].