Koksma boaske 1933 oan Grietje van der Stouwe, sy krigen fiif soannen en twa dochters. Twa bruorren fan Koksma wienen ek wiskundige: Jan Koksma en Marten Koksma.
Literatuer
Arie van Deursen: The distinctive character of the Free University in Amsterdam, 1880-2005, Eerdmans Publishing (2008).
Lauwerens Kuipers en Jan Popken: In memoriam J.F. Koksma (1904–1964), Nieuw Archief voor Wiskunde, Serie 3, 13 (1965), s. 1–18.