עונת 1999/2000 הייתה העונה ה-69 של לה ליגה, שהיא הליגה הספרדית הבכירה בכדורגל. העונה החלה ב-21 באוגוסט 1999 והסתיימה ב-20 במאי 2000.
הליגה כללה 20 קבוצות. שלוש הקבוצות האחרונות ירדו לליגת המשנה בסוף העונה.
על ניצחון במשחק ליגה הוענקו שלוש נקודות.
מליגת המשנה עלו מאלגה, נומנסיה, ראיו ואיקאנו וסביליה.
דפורטיבו לה קורוניה זכתה בתואר בפעם הראשונה בתולדות המועדון. היא אף זכתה בסופר קאפ הספרדי תוך ניצחון על אספניול בסיכום מפגש כפול - 0:2, 0:0.
סביליה, אתלטיקו מדריד (לראשונה מאז עונת 1933/1934) וריאל בטיס ירדו לליגת המשנה בסוף העונה.
כדורגלנים מצטיינים
פרס פיצ'יצ'י, מלך השערים של העונה: סאלבה (ספרד ספרד), ראסינג סנטנדר, שכבש 27 שערים.
פרס זאמורה, המוענק לשוער הטוב ביותר: מרטין הררה (ארגנטינה ארגנטינה), דפורטיבו אלאבס, שספג 37 שערים ב-38 משחקים.
פרס דון בלון, למצטייני העונה בליגה, הוענק על ידי העיתון "דון בלון":
טבלת הליגה
סטטיסטיקה
מלכי השערים
מלכי הבישולים
קישורים חיצוניים