Od 1971. do 1997., Medlionev internetski pristup prema kompjuteriziranoj bazi podataka MEDLARS bio je primarno preko kapaciteta ustanova kao što su sveučilišne knjižnice. PubMed je proradio siječnja 1996. i uveo je u eru privatnog, besplatnog, kućnog i uredskog pretraživanja Medlinea.[1] Sustav PubMed ponuđen je javnosti na besplatni pristup, kad je dopredsjednik Al Gore u ceremoniji demonstrirao pretraživanje Medlinea preko mreže.[2]
PubMed nije isto što i PubMed Central. To su dva servisa koja su vrlo različita u svojoj biti.[3]