1980-ban kezdett el úszni Szegeden, a Szeol versenyzőjeként. Utánpótlás versenyzőként első országos sikereit 1985-ben érte el gyors- és hátúszó számokban. Egy év múlva, korosztályában 7 bajnoki címet szerzett, ekkor már a vegyes számokban is a legjobbnak bizonyult. 1988-ban a gyulai IBV-n aranyérmet szerzett 4 × 100 méter gyorsváltóban, a hátúszószámokban pedig ezüstérmes lett. Még serdülő versenyzőként, 1989-ben szerezte első felnőtt bajnoki címét 4 × 100 méteres vegyes váltóban. Ugyanebben az évben 1 arany és 4 ezüstérmet nyert a lipcsei IBV-n.
1990-ben indult a dunkerque-i ifjúsági Európa-bajnokságon, ahol 100 méter háton 5., 200 méter háton 9., a 4 × 100 méteres vegyes váltóval hatodik lett. A decemberi felnőtt bajnokságon minden éremfajtából kettőt szerzett. Teljesítményével bekerült a perthi világbajnokságon induló csapatba.
Az 1991-ben rendezett vb-n 200 vegyesen 10., 100 háton 13., 200 háton 19. lett. Az áprilisában a Újpestből a Budapesti Rendészeti Sportegyesülethez igazolt. Az antwerpeni ifi Eb-re esélyesként utazott, de egy vírusos betegség miatt nem tudott elindulni a versenyen. Az athéni felnőtt Eb-n 200 vegyesen ötödik, 100 háton nyolcadik lett.
Az 1992-es országos bajnokságon 7 aranyérmet (200 és 400 vegyes, 200 pillangó, 200 gyors országos csúccsal, 4 × 100 és 4 × 200 gyorsváltó, 4 × 100 vegyes váltó) szerzett. A barcelonai olimpián 400 méter vegyesen éppen bejutott a B-döntőbe. Végül 9. helyezett lett. 200 vegyesen ötödikként került a döntőbe. A fináléban sokáig vezette a mezőnyt, de végül az egyéni csúcsa a harmadik helyhez volt elegendő.
1993–1996
1993 júniusában a OTP Sport Plusz SE-be igazolt. Az országos bajnokságon 200 méter gyorson tudott nyerni. A sheffieldi Eb-n bemelegítésként 200 méter gyorson lett 10. helyezett. 200 vegyesen a legjobb idővel jutott a döntőben, de a fináléban egyéni legjobbja az ezüstérmet jelentette számára. Az 1994-es ob-n négy aranyérmet nyert, ebből 50 méter gyorson országos csúccsal. A szeptemberi, római világbajnokságon a 200 méter gyors döntőjében országos csúcsot úszott és hatodik lett. 100 gyorson az előfutamban és a B-döntőben is országos csúcsot úszott és végül 10. helyen zárt. 200 méter vegyesen és a 4 × 100 méteres vegyes váltóban bronzérmet szerzett.
Az 1995-ös magyar bajnokságon 12 számban indult és mindegyikben megszerezte a bajnoki címet (50 és 200 méter gyorson országos csúccsal). A bécsi Európa-bajnokságon 200 méter gyorson 8. lett. A döntőre Czene késéssel érkezett, csak a versenyzők bemutatása alatt ért a medencéhez. A közjáték rányomta bélyegét a versenyzésére. Az ob-n elért csúcsával (melytől 3 másodperccel maradt el) dobogós lett volna. 100 gyorson is döntőbe került, ahol hetedik helyen végzett. 200 vegyesen elsőként került a döntőbe, ahol ezüstérmes lett. A 4 × 100 méteres gyorsváltóval 8., a vegyes váltóval második lett.
Az 1996-os ob-n csak a hatodik napon tudott indulni, mert a verseny előtt a térdét beverte, amely nem volt sportolásra alkalmas állapotban. Így csak a 200 méteres vegyesúszásban és 4 × 100 méteres vegyes váltóban lett bajnok. Az olimpián 200 gyorson a 20., 200 pillangón 9. lett. 200 vegyesen hetedikként jutott a döntőbe, ahol az egyes pályát kapta. A döntőben egyéni csúccsal és olimpiai rekorddal megszerezte a bajnoki címet. Életében első alkalommal került 2 perc alá a 200 vegyesen elért ideje. A vegyes váltóban csak a döntőben szerepelt, ahol hatodik lett. Szeptemberben bekerült a Magyar Úszó Szövetség elnökségébe. Decemberben Rózsa Norberttel együtt megválasztották az év úszójának. Az év sportolója szavazáson a második lett.
1997–2000
Az 1997-es Európa-bajnokságon nem indult, a decemberi ob-n 5 versenyszámot nyert meg. Az 1998-as, perthi vb-n 100 méter gyorson 32. lett. 200 vegyesen csak a B-döntőbe jutott és összesítésben 9. helyezést ért el. A 4 × 100 méteres vegyes váltóval bronzérmet szerzett. Júliusban a 2000-es olimpiáig tartó szerződést kötött a Sport Plusz SE-hez. Az 1998-as ob-n csak váltószámokban indult. Egy évvel később 200 vegyesen lett magyar bajnok. Az isztambuli Eb-n 200 vegyesen 6. lett.
2000-ben az USA-ba költözött, hogy egyetemre járjon. Márciusban az Arizona Egyetem színeiben versenyezve beállította Jani Sievinen 200 méter vegyesen, rövidpályán tartott világcsúcsát. A májusi ob-re nem tért haza Amerikából. Az olimpián a 4 × 200 méteres gyorsváltóval, új országos csúccsal 10. lett. 200 vegyesen negyedik helyen ért célba. Az esztendő végén ismét elnyerte az év úszója címet.
2005-től 2009-ig a FINA (Nemzetközi Úszószövetség) Sportolói Bizottságának volt tagja volt. 2005-től a MOB tagja. 2008-tól a Magyar Úszószövetség Elnökségi tagja.[2] 2013 decemberében a Magyar Szabadidősport Szövetség elnökének választották.[3] 2014 januárjában a Magyar Olimpiai Bizottság szabadidősportért felelős tagozatának lett a vezetője.[4]
2015 októberében beválasztották a nemzetközi szabadidősport világszervezet (TAFISA) elnökségébe.[5]
Köztisztviselőként
2010. június 2.[6] és 2012. október 7. között[7] a Nemzeti Erőforrás Minisztériumának sportügyeket felügyelő államtitkára volt.[8] Ezt követően a Nemzeti Sport Intézet (NSI) főigazgatójának nevezték ki.[9] Később a Nemzeti Sportközpontokban a Nemzeti Sportinformációs Rendszer fejlesztési igazgatója lett.[10]
Nős, felesége Czene-Bánhidi Petra táncpedagógus, koreográfus, többszörös argentin tangó világbajnok. 2017 novemberében született meg első gyermekük, Laura.