Teljes pályafutását az Internazionale csapatánál töltötte, a 80-as, 90-es évek olasz válogatottjának is meghatározó tagja volt.
1980 őszén mutatkozott be a Serie A-ban, 17 évesen. Összesen 19 szezont játszott az Internél, ebben az időben azonban csapata a városi rivális AC Milan árnyékából nem volt képes kitörni: mindössze egy bajnoki címet szereztek (1989).
A nemzetközi kupaporondon lényegesen eredményesebbek voltak: Bergomi időszakában négy UEFA-kupa-döntőből háromszor nyertek (1991, 1994, 1998) és a negyedik döntőt (1997) is csak tizenegyesekkel veszítették el.
A válogatottal Bergomi részese volt az 1982-es világbajnoki diadalnak. Részt vett a következő két világbajnokságon is, valamint az 1988-as Európa-bajnokságon. Az 1992-es Európa-bajnokság egyik selejtezőjében kiállították (Norvégia ellen) és évekig nem hívták meg újra a csapatba. Végül meglepetésre ott lehetett az 1998-as világbajnokságon.
1999-ben vonult vissza, 81 válogatott mérkőzéssel a háta mögött.
2004 márciusában ő is fölkerült a Pelé által összeállított FIFA 100 listára.