Már a trianoni békeszerződés utáni években is felmerült a kicsire zsugorodott dunáninneni és tiszai egyházkerületek összevonása. De az ősi kerületek gyülekezetei ragaszkodtak a történelmi keretekhez. 1952-ben pártállami nyomásra – nem utolsósorban Turóczy Zoltán és Szabó József püspökök eltávolításának a céljával – számolta fel a zsinat a négy egyházkerületet, és állított fel helyettük két újat. Az Északi Egyházkerület 1952. július 1-jei hatállyal jött létre, első püspöke az addigi tiszai egyházkerületi püspök, Vető Lajos, egyházkerületi felügyelője Margócsy Emil, az addigi tiszai kerületi felügyelő lett. Az egyházkerület területét a dunáninneni és tiszai kerületek, a dunántúli egyházkerület északi fele és a bányai egyházkerület budai gyülekezetei alkották. Az egyházmegyei határok ugyanekkori átrajzolásával a kerületet – egészen 2000-ig – nyolc egyházmegye alkotta: a Borsod-Hevesi, Budai, Fejér-Komáromi, Győr-Soproni, Hajdú-Szabolcsi, Nógrádi, Vasi és Veszprémi Egyházmegyék. Az első néhány év az egyházkerület számára is a megfélemlítés és az egyházi élet visszaszorításának időszaka volt.
A kommunista diktatúra évei után az 1956-os forradalom hatására Vető püspök november 1-jén lemondott hivataláról, így 1957 januárjában a kerület gyülekezetei szabadon választhatták meg Turóczy Zoltánt püspöküknek, Mády Zoltánt pedig kerületi felügyelőnek. Hivatalukba 1957. február 6-án iktatta be őket Ordass Lajos déli egyházkerületi püspök, de az Állami Egyházügyi Hivatal december elején félreállította őket, és újra Vető Lajos került az északi kerület élére. Őt Ottlyk Ernő, majd Nagy Gyula követte. Nagy Gyula püspök a rendszerváltáskor, 1990 elején lemondott, nyugdíjba vonult. Utódjának a gyülekezetek Szebik Imre budai esperest választották, akit 1990. március 17-én iktattak be hivatalába.
2000-ben harmadik kerületként újra létrejött a Nyugati (Dunántúli) Egyházkerület, és az északi kerülettől hozzá került a Fejér-Komáromi, Győr-Soproni, Vasi és Veszprémi Egyházmegye. Viszont a déli kerülettől átkerült Északhoz a Dél-Pest Megyei és az Észak-Pest Megyei Egyházmegye, így az egyházkerületnek hat egyházmegyéje lett. 2006-ban Szebik Imre elérte a nyugdíjkorhatárt, a kerület Dr. Fabiny Tamás teológiai tanárt választotta meg utódjának, beiktatására 2006. március 25-én került sor Miskolcon.
Margócsy Emil 1952–1954
Mády Zoltán 1957
Dr. Fekete Zoltán 1958–1973
Dr. Mihály Dezső 1974–1983
Farkasházi Ferenc 1987–2000
Benczúr László 2000–2012
Dr. Fábri György 2012–napjaink
Szervezeti felépítés
79 egyházközség található az egyházkerület területén, ezek 6 egyházmegyét alkotnak: