Nell'estate1998, dopo alcune positive stagioni nel PSG, fu prelevato dal Milan, con cui, tuttavia, non riuscì ad esprimersi su alti livelli. Poco schierato dal primo minuto di gioco, nel 1998-1999 vinse lo scudetto in maglia rossonera collezionando 25 presenze in Serie A e segnando un gol decisivo (Bologna - Milan 2-3 al 93'). Nella successiva stagione 1999-2000 fu schierato con ancora meno frequenza e nel gennaio 2000 fu ceduto in prestito al Venezia.
Nell'estate 2000 si trasferì all'Olympique Marsiglia e nella stagione successiva andò in prestito al Bolton. L'esordio con il Bolton risale al 19 settembre 2001, il suo primo gol per i Trotters, invece, lo mise a segno contro l'Everton (sconfitta per 3-1)[1] il 1º aprile 2002. Nel gennaio 2002 il trasferimento divenne definitivo. N'Gotty militò nel club fino a maggio 2006, quando la società e l'allenatore Sam Allardyce, seguendo una politica di ringiovanimento della squadra, decisero di non rinnovargli il contratto.
Nella stagione 2008-2009 viene ceduto in prestito al Hereford United. A fine stagione il Leicester gli ha rescisso il contratto.[2]
Nel 2011 ritorna a giocare a livello amatoriale, venendo ingaggiato dall'AS Lattes (DH Languedoc-Roussillon, 6ª divisione francese), squadra di Lattes (Linguadoca-Rossiglione)[3]. Nel 2013 passa all'UF Belleville-St-Jean-d'Ardières, squadra di Belleville (Rodano-Alpi), anch'essa militante della 6ª divisione francese.[4][5]
Nel 2015 si ritira dal calcio giocato, divenendo l'allenatore del Belleville.[6]
Statistiche
Cronologia presenze e reti in nazionale
Cronologia completa delle presenze e delle reti in nazionale ― Francia