Soprannominato "El Picapietre", Claudio Husaín crebbe calcisticamente nelle file del Vélez Sársfield, che resta ancora oggi la squadra dove ha giocato più partite. Passato al River Plate nel gennaio 2000, fu poi acquistato dal Napoli, dove esordì in Serie A e giocò 29 partite. Nonostante questo non convinse la società che l'anno successivo lo cedette in prestito al River Plate, dal quale tornò nel gennaio successivo, con il Napoli in B, dove giocò poco e senza incidere (appena 11 presenze).
Ceduto in via definitiva al River Plate, ha poi giocato in Messico con il Tigres, prima di tornare definitivamente in Argentina, acquistato dal Newell'Old Boys.
Nazionale
In nazionale vanta 14 presenze, ha partecipato all'edizione del 1997 e del 1999 della Copa América, inoltre è stato convocato per il campionato del mondo 2002, senza però mai giocare.
Vita privata
Suo fratello minore Dario Husaín è anch'egli un ex calciatore.
Statistiche
Cronologia presenze e reti in nazionale
Cronologia completa delle presenze e delle reti in nazionale ― Argentina
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