Ad organizzare il torneo fu il Paraguay e le partite si svolsero dal 29 giugno al 18 luglio 1999. Il Paese sudamericano organizzava per la prima volta il torneo nel proprio suolo nazionale, dopo le due edizioni organizzate, a proprie spese, in Uruguay nel 1924 e in Perù nel 1953. Vincitore del torneo fu il Brasile, che in finale batté l'Uruguay per 3-0 e si aggiudicò così il suo sesto trofeo (il terzo con la nuova denominazione di Copa América).
Città e stadi
Sedi della Copa América 1999 furono le seguenti città con i relativi stadi:
Per l'edizione 1999 venne confermata la formula sperimentata nelle tre edizioni precedenti, con 12 nazionali partecipanti divise in 3 gironi all'italiana da 4 ciascuno. Le prime due classificate più le 2 migliori terze si sarebbero qualificate ai quarti. Da questo momento il torneo avrebbe preso la forma dell'eliminazione diretta.
Nazionali partecipanti
Per la prima volta nella storia della Copa América, prese parte al torneo una nazionale asiatica: era il Giappone, invitato al torneo insieme al Messico (oltre alle dieci nazionali affiliate alla CONMEBOL). La presenza dei giapponesi aveva soprattutto origine commerciale, poiché la Toyota aveva dall'anno prima assunto la sponsorizzazione della Coppa Libertadores.
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