Fontana ha iniziato a giocare nei dilettanti dello Schio. Nel 1963 è stato acquistato dal Lanerossi Vicenza, con cui ha esordito in Serie A il 19 gennaio 1964 al Braglia contro il Modena.[1] Nella prima stagione tra i professionisti ha disputato 8 partite in campionato, mentre nelle stagioni seguenti è stato impiegato sempre di più, fino a diventare titolare e a collezionare 98 presenze e 7 gol nella massima serie del campionato italiano di calcio.
A Vicenza è tornato a essere titolare ed è rimasto fino al 1972, quando si è trasferito al Napoli. Anche a Napoli ha trascorso una sola stagione per poi ritornare al Lanerossi Vicenza nell'ottobre 1973.[1] È rimasto con i veneti per altri due anni, collezionando in totale 171 presenze e 12 gol in Serie A.
Dopo essere rimasto svincolato,[1] nel 1975 ha firmato per il Ravenna in Serie C, dove ha chiuso la carriera l'anno seguente dopo la retrocessione degli romagnoli in Serie D.