La prima partita in nazionale di Heidi Mohr è stata Norvegia - Germania finita 0:0 il 19 maggio 1986. Nell'Europeo 1989, in Germania Ovest, affrontò l'Italia (1-1, 4-3 d.c.r) in semifinale e segnò in finale contro la Norvegia (4-1) vincendo. Nel Mondiale 1991, in Cina, segnò 7 gol; 2 contro la Nigeria (4-0),1 contro Taipei Cinese(3-0) e un altro contro l'Italia (2-0) nella fase a gironi, uno contro la Danimarca (2-1) ai quarti di finale e uno contro gli Stati Uniti (2-5) in semifinale e poi perse la finale 3º posto arrivando al 4º. Nell'Europeo 1991, in Danimarca, fù la capocannoniere del torneo con 4 gol; 2 contro l'Italia (3-0) in semifinale e altri 2 in finale contro la Norvegia (3-1) diventando campionessa d'Europa per la seconda volta. Nell'Europeo 1993, in Italia, segnò in semifinale contro l'Italia (1-1, 3-4 d.c.r.), siccome aveva perso in semifinale andò in finale 3º posto, perdendo contro la Danimarca (1-3) arrivando 4º. Nel Mondiale 1995, in Svezia, segnò 3 gol; 2 contro il Brasile (6-1) ai gironi, passandoli, e l'altro gol ai quarti contro l'Inghilterra (3-0), alla fine arrivò seconda passando contro la Cina (1-0) e perdendo in finale contro la Norvegia per 0-2. Nell'Europeo 1995 segnò 2 gol, tutti e due contro l'Inghilterra (6-2) in semifinale, in finale vinse 3-2 contro la Svezia. Nelle Olimpiadi 1996 segnò un gol contro il Giappone (3-2), non passò i gironi.
La sua ultima partita in nazioanle fù contro l'Islanda il 29 settembre 1996.
Morte
Heidi Mohr è morta a Weinheim il 7 febbraio 2019 dopo una lunga battaglia contro il cancro.[1]