Nel 1887 divenne professore di ostetricia presso l'Università di Basilea, e poi ha servito come professore presso le università di Halle (1894) e Strasburgo (1900). All'indomani della prima guerra mondiale, Fehling insieme ad altri professori tedeschi furono espulsi dall'Università di Strasburgo. Alla fine si stabilì a Baden-Baden, dove morì nel 1925.
Hermann Fehling era considerato uno dei ginecologi più importanti della sua epoca, e ha dato un contributo nella sua ricerca di eclampsia e di osteomalacia. Nel 1877, con Heinrich Fritsch (1844-1915), ha fondato la rivista Zentralblatt für Gynäkologie.
Pubblicazioni principali
Die Physiologie und Pathologie des Wochenbetts, fur Studirende und Arzte, 1890.
Lehrbuch der Frauenkrankheiten, 1900.
Entwicklung der Geburtshilfe und Gynakologie im 19. Jahrhundert, 1925.