Tra le città principali situate sulle coste che si affacciano sul mar di Bohol ci sono Iligan, Butuan e Cagayan de Oro.
Il mar di Bohol si collega al mar delle Filippine con due stretti e piccoli mari quello di Surigao e il mar di Camotes.
Molte sono le isole che sono presenti nel mare, le due principali sono Siquijor e Provincia di Camiguin.