La carriera di Alliot cominciò nel 1976, quando iniziò a correre in Formula Renault. Vi rimase anche nel 1977 e nel 1978, anno in cui vinse il titolo. Dopo questo successo nel 1979 emigrò nella Formula 3 francese, passando l'anno successivo alla Formula 3 europea. Nel 1983 Philippe corse in Formula 2 e nello stesso anno partecipò alla 24 Ore di Le Mans, giungendo terzo in coppia con Mario e Michael Andretti.
Formula 1
Dopo questi buoni risultati Alliot nel 1984 tentò la strada della Formula 1 e venne ingaggiato dalla RAM, vettura poco competitiva con cui non riuscì a conquistare buoni risultati, venendo spesso costretto al ritiro.
L'anno successivo, però, la scuderia francese non lo confermò e passò alla Larrousse. A una prima stagione mediocre con tre punti conquistati ne seguirono una seconda catastrofica senza risultati e una terza con appena un punto totalizzato.
Nel 1990 una Ligier non più brillante lo richiamò. La stagione fu disastrosa e a fine anno Alliot lasciò la Formula 1.
Tornato in Formula 1 con la Larrousse Alliot disputò una stagione non brillante dovuta alla sua vettura, non molto veloce, ma riuscì a conquistare un buon quinto posto a Imola. A fine anno lasciò nuovamente la massima serie, salvo per fare due apparizioni per sostituire Hakkinen e Beretta nel 1994.
Il ritiro dalle corse
Ritiratosi dalle corse nel 2003 Alliot svolge tuttora l'attività di commentatore e partecipa alla Parigi-Dakar.